基礎醫(yī)學院是浙江中醫(yī)藥大學歷史最悠久的院系之一，學院始創(chuàng)于1984年，原為浙江中醫(yī)學院基礎部，1999年更名為基礎醫(yī)學系，2006年更名為基礎醫(yī)學院，目前共有教職工163人，下設15個教研室和機構，中高級職稱人員占比84.05%。學院師資力量雄厚，擁有全國名中醫(yī)、國家973項目首席科學家、國家萬人計劃“科技創(chuàng)新領軍人才”、國家重點研發(fā)計劃首席科學家、國家萬人計劃教學名師、“國家百千萬人才工程”百層次人才、岐黃學者、浙江省“萬人計劃”教學名師等一大批高層次人才。

學院現(xiàn)有中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)臨床基礎、方劑學、中醫(yī)醫(yī)史文獻、中醫(yī)診斷學等5個中醫(yī)學博士學位點和中西醫(yī)結合基礎博士學位點，中醫(yī)學(含中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)臨床基礎、方劑學、中醫(yī)醫(yī)史文獻、中醫(yī)診斷學、中醫(yī)內科學)碩士學位點6個、基礎醫(yī)學碩士學位點1個、中醫(yī)藥生物工程碩士學位點1個。現(xiàn)有博士生導師24人，碩士生導師63人。近年來，導師團隊獲得中國學位與研究生教育學會醫(yī)藥學研究生教育成果二等獎、浙江省科學技術進步一等獎、浙江省優(yōu)秀研究生教學案例獎一等獎等獎項。研究生獲得全國中醫(yī)藥優(yōu)秀博士學位論文提名1項、省級優(yōu)秀博士學位論文1項、提名1項、省級優(yōu)秀碩士學位論文1項，參加“岐黃杯”、“遠志杯”等國家級學術活動獲獎共計20余次。

學院全力推進學科發(fā)展，擁有國家重點學科1個，國家中醫(yī)藥管理局重點學科4個，省重點建設高校優(yōu)勢特色學科1個，省一流學科2個，省重中之重學科3個，省重點學科2個，省中醫(yī)藥重點學科2個。擁有國家中醫(yī)藥管理局重點實驗室、中醫(yī)風濕病重點研究室、國家中醫(yī)藥科研三級實驗室中醫(yī)臨床基礎實驗室、省“2011協(xié)同創(chuàng)新中心”免疫性疾病中醫(yī)診治協(xié)同創(chuàng)新中心、浙江省中醫(yī)風濕免疫重點實驗室、浙江省中醫(yī)腦病重點實驗室、浙江省中醫(yī)“瘀毒證”重點實驗室、中醫(yī)“治未病”智慧健康浙江省工程研究中心、中藥真實世界循證與轉化浙江省工程研究中心、浙江中醫(yī)藥大學中醫(yī)“治未病”智慧健康區(qū)域產業(yè)創(chuàng)新與發(fā)展軟科學研究基地。

近五年，學院發(fā)表SCI收錄文章300余篇，其中中科院一區(qū)論文23篇;主持各類項目約230項，獲批直接經(jīng)費超6100萬元，其中國家級項目45項，省部級項目43項，包括國家重點研發(fā)計劃項目2項，國家自然科學基金重點項目1項，國家自然基金區(qū)域創(chuàng)新發(fā)展聯(lián)合基金重點項目1項，國家社會科學基金立項2項，浙江省尖兵領雁項目1項，省哲學社會科學規(guī)劃重大課題1項;制定團體標準6項，獲得軟件著作權12項，授權專利38項;獲得國家科學技術進步獎二等獎、省科學技術進步獎一等獎、中國中西醫(yī)結合學會科學技術獎一等獎、中華中醫(yī)藥學會科學技術獎一等獎等各類獎項共計80余項。

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