北華大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院成立于2007年5月，其前身為吉林醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部。1984年5月前全稱為吉林醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)部，1984年5月合并于吉林醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)系，1987年7月恢復(fù)成立吉林醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部。

吉林醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部共有教職員工150余人，下設(shè)14個教研室，7個教學(xué)實(shí)驗(yàn)室，4個專業(yè)研究室和1個中心實(shí)驗(yàn)室。有1個病理學(xué)與病理生理學(xué)碩士授權(quán)點(diǎn)，每年招生2名。

1999年10月北華大學(xué)成立，基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部隸屬于北華大學(xué)醫(yī)學(xué)院。2007年5月成立北華大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，首任院長何欣，黨總支書記劉玉和;2010年6月增選蘆麗莉同志為教學(xué)副院長;2016年5月劉玉和書記調(diào)出，張維瑜同志任基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院黨總支書記。

2018年5月恢復(fù)成立北華大學(xué)醫(yī)學(xué)院，撤銷基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院，學(xué)院下設(shè)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)部。

2020年7月恢復(fù)北華大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院建制，院長李詠梅，黨委書記張維瑜，教學(xué)副院長王海鵬，科研副院長于春艷。

學(xué)院現(xiàn)有教職工105人，下設(shè)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)理論教學(xué)中心、實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心、科學(xué)研究平臺、創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)實(shí)踐教育基地。涵蓋12個教研室，5個實(shí)驗(yàn)部。建有省級重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個，省級創(chuàng)新研究中心1個;省級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心1個，省級拔尖人才培養(yǎng)基地1個，市廳級科技創(chuàng)新團(tuán)隊2個，校級優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊1個?，F(xiàn)有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)1個，覆蓋人體解剖與組織胚胎學(xué)、病理學(xué)與病理生理學(xué)、病原生物學(xué)、免疫學(xué)、法醫(yī)學(xué)5個二級學(xué)科。